Afrique du Sud: des infections antérieures pourraient expliquer le taux d’hospitalisation d’Omicron

Des niveaux élevés d’infection antérieure dans la province au centre de l’éclosion pourraient être à l’origine d’un niveau relativement faible de maladie grave, selon un expert

Des niveaux élevés d’exposition antérieure à trois vagues précédentes d’infection à coronavirus en Afrique du Sud peuvent expliquer les niveaux relativement faibles d’hospitalisation et de maladie grave dans l’épidémie actuelle de la variante Omicron, plutôt que la variante elle-même étant moins virulente.

Des experts en Afrique du Sud

La suggestion a été faite par l’expert en vaccins Shabir Madhi de l’Université du Witwatersrand, qui a dirigé des essais de vaccins dans le pays. Il a averti que l’expérience de l’Afrique du Sud sur l’Omicron pourrait ne pas être un indicateur fiable de la façon dont l’épidémie d’Omicron se déroule dans d’autres pays.

Le même message a été repris par le chef de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS), Tedros Adhanom Ghebreyesus, qui a déclaré qu’il était “faux pour les gens de considérer l’Omicron comme doux”.

D’autres hauts responsables de l’OMS, avertissant que le pic d’Omicron pourrait être atteint dans des semaines car il se propagerait rapidement, ont ajouté que les preuves actuelles suggéraient que les vaccins ne manquaient pas de protéger contre l’Omicron et offraient un certain degré de protection.

Dans une longue interview avec le Centre de coordination des crises sanitaires mondiales, Madhi a cité une enquête de séropositivité récemment terminée – le pourcentage de la population qui a déjà été infectée – dans la province de Gauteng, qui a été au centre de l’épidémie d’Omicron, qui suggérait que 72% avaient déjà été infectés par le coronavirus.

C’est bien plus de trois fois le taux d’infections précédentes détectées par une enquête similaire lors de l’épidémie de variante bêta il y a un an, où la séropositivité était de 20%.

Alors que Madhi a déclaré que les preuves émergentes indiquaient que l’Omicron était à la fois plus infectieux et plus capable d’échapper à la protection contre les anticorps, il a suggéré que d’autres mécanismes à l’œuvre dans l’immunité acquise par infection pourraient expliquer les niveaux inférieurs d’hospitalisations et de maladies graves.

Alors que le Royaume-Uni a un taux de séropositivité supérieur à 90%, l’expérience de l’Afrique du Sud peut être très différente de celle du Royaume-Uni en termes d’Omicron, le Royaume-Uni ayant une population plus âgée et des vulnérabilités différentes à la maladie.

Les commentaires de Madhi sont intervenus alors qu’un deuxième grand assureur santé sud-africain, Discovery Health, a signalé moins de cas de maladie grave que les variantes précédentes du coronavirus, signalant que dans 211 000 cas de coronavirus positifs, le risque d’hospitalisation chez les adultes était 29% inférieur à celui de la vague pandémique initiale apparue en mars 2020.

“L’évolution de la variante Omicron arrive à un stade très différent de la pandémie”, a déclaré Madhi. « Il est important de garder cela à l’esprit lorsque nous voyons ce qui se passe en Afrique du Sud et ce que nous pourrions voir dans d’autres contextes, qui pourraient avoir une épidémiologie très différente.”

Une protection par les infections antérieures

“En Afrique du Sud, une grande partie de l’immunité qui existe actuellement est en grande partie due à l’infection antérieure qui a eu lieu au cours des trois premières vagues”, a-t-il ajouté. « Dans une enquête qui vient de se terminer fortuitement dans [la province du Gauteng] vendredi, nous démontrons que la séropositivité à Gauteng est d’environ 72%.

« Il est important de garder cela à l’esprit lorsque nous voyons ce qui se déroule en Afrique du Sud et ce à quoi nous pourrions nous attendre dans d’autres contextes.”

Abordant la question de savoir si l’Omicron est “plus doux“ que les autres variantes précédentes, Madhi a déclaré que les niveaux élevés d’exposition précédente signifiaient que les experts étaient « tout simplement incapables de faire une comparaison directe significative de la virulence avec Omicron par rapport aux autres variantes.

« [Cela] implique en raison du fondement de l’immunité qui existe actuellement et qui est différent de ce qui existait dans le passé, et que l’immunité va entraîner un certain changement dans l’évolution clinique de l’infection, y compris la probabilité que l’infection évolue vers une maladie grave.”

“Ce qui est assez fascinant, c’est qu’en prenant le taux d’infection pour 100 000 et en le comparant au taux d’hospitalisation ainsi qu’au taux de mortalité, le taux d’hospitalisation est beaucoup plus faible par rapport à ce qui était le taux de cas équivalent dans les trois premières vagues qui se sont produites.

« Cela nous indique donc que quelque chose est en jeu lorsque la force élevée des infections par Omicron ne se matérialise pas en termes de maladies graves et de décès en grand nombre.”

Citant des preuves de la capacité d’Omicron à échapper à la protection contre les anticorps, il a suggéré que les données “rassemblaient” que l’immunité contre les lymphocytes T pourrait conduire à une protection contre des maladies plus graves.

Méconnaissance des impactes d’Omicron

Alors que l’attention mondiale est étroitement focalisée sur le déroulement de l’épidémie d’Omicron en Afrique du Sud, certains médias ont suggéré les premières preuves que les cas d’Omicron en Afrique du Sud pourraient s’aplatir. Les rapports, basés sur des chiffres quotidiens plutôt que hebdomadaires plus fiables, semblaient se concentrer sur les fluctuations de la déclaration des cas dans le Gauteng plutôt que sur l’Afrique du Sud plus largement.

Contredisant ces affirmations, les rapports de l’Institut national des maladies transmissibles du pays, qui suggéraient lundi que les infections à Covid – Delta et Omicron – continuaient de prendre de l’ampleur, le ministère de la Santé du KwaZulu-Natal affirmant que la province enregistrait plus de 2 000 nouveaux cas par jour, tandis qu’au Cap Oriental, le taux de positivité de Covid-19 était passé à 17,8%.

L’argument de Madhi semble avoir le soutien de certains autres experts. Tulio de Oliveira, qui dirige deux instituts de séquençage génétique en Afrique du Sud, a déclaré à CBS ce week-end: “Vous avez de grandes poches d’immunité de la population We Nous allons devoir nous séparer si les cas bénins sont dus à des jeunes infectés ou si l’immunité de la population précédente contre l’infection et la vaccination sont responsables de la diminution du nombre de personnes hospitalisées.”

Selon l’OMS, d’autres pays africains contribuent également à une augmentation massive des cas de Covid au cours de la dernière semaine, mais le nombre de décès, pour l’instant du moins, est inférieur à celui des vagues précédentes.

La hausse de 83% signifie cependant que le continent ne recevra pas 70% des personnes entièrement vaccinées – considérées comme essentielles pour stopper la pandémie – avant août 2024.

“Nous sommes prudemment optimistes sur le fait que les décès et les maladies graves resteront faibles dans la vague actuelle”, a déclaré le Dr Matshidiso Moeti, directeur régional de l’OMS pour l’Afrique. « Mais la lenteur du déploiement des vaccins en Afrique signifie que les deux seront beaucoup plus élevés qu’ils ne devraient l’être.”

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